Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Higd1cQ76I25 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Higd1cQ76I25 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms