Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms