Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Gm27231-201ENSMUST00000185191 551 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
BC061212Q6P8K3 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms