Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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PcolceQ61398 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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PcolceQ61398 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
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PcolceQ61398 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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PcolceQ61398 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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PcolceQ61398 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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PcolceQ61398 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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PcolceQ61398 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
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PcolceQ61398 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PcolceQ61398 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
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PcolceQ61398 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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