Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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Traf3Q60803 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Traf3Q60803 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Traf3Q60803 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Traf3Q60803 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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