Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tnfsf15Q5UBV8 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Tnfsf15Q5UBV8 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tnfsf15Q5UBV8 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tnfsf15Q5UBV8 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tnfsf15Q5UBV8 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tnfsf15Q5UBV8 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tnfsf15Q5UBV8 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tnfsf15Q5UBV8 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tnfsf15Q5UBV8 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tnfsf15Q5UBV8 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Tnfsf15Q5UBV8 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tnfsf15Q5UBV8 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tnfsf15Q5UBV8 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tnfsf15Q5UBV8 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Tnfsf15Q5UBV8 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Tnfsf15Q5UBV8 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Tnfsf15Q5UBV8 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Tnfsf15Q5UBV8 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Tnfsf15Q5UBV8 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Tnfsf15Q5UBV8 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Tnfsf15Q5UBV8 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Tnfsf15Q5UBV8 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Tnfsf15Q5UBV8 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Tnfsf15Q5UBV8 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Tnfsf15Q5UBV8 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms