Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms