Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r196Q5SVD5 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms