Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms