Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Usp48Q3V0C5 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Usp48Q3V0C5 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Usp48Q3V0C5 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Usp48Q3V0C5 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Usp48Q3V0C5 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Usp48Q3V0C5 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp48Q3V0C5 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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