Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Gm29609Q3UU56 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm29609Q3UU56 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm29609Q3UU56 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm29609Q3UU56 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm29609Q3UU56 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm29609Q3UU56 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm29609Q3UU56 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm29609Q3UU56 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm29609Q3UU56 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm29609Q3UU56 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm29609Q3UU56 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm29609Q3UU56 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm29609Q3UU56 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm29609Q3UU56 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm29609Q3UU56 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm29609Q3UU56 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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