Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3UPC7 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3UPC7 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3UPC7 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3UPC7 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3UPC7 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3UPC7 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3UPC7 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3UPC7 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3UPC7 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3UPC7 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3UPC7 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q3UPC7 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms