Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Parp3Q3ULW8 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms