Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Usp19Q3UJD6 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Usp19Q3UJD6 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Usp19Q3UJD6 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Usp19Q3UJD6 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
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Usp19Q3UJD6 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp19Q3UJD6 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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