Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms