Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf224Q3UIW8 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms