Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Tipin-205ENSMUST00000216594 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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Rnf180Q3U827 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Gstm2-202ENSMUST00000066530 854 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Rnf180Q3U827 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rnf180Q3U827 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rnf180Q3U827 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rnf180Q3U827 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rnf180Q3U827 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rnf180Q3U827 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Gm10581-201ENSMUST00000097986 231 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf180Q3U827 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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