Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Mterf4-201ENSMUST00000027492 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Gm14445-201ENSMUST00000117051 1484 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Zfp973-201ENSMUST00000108985 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Gm11854-201ENSMUST00000117839 446 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Gm23429-201ENSMUST00000122486 149 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Gm14435-202ENSMUST00000127687 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Gm25557-201ENSMUST00000158084 315 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Vmn2r-ps84-201ENSMUST00000173377 897 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 1700108F19Rik-201ENSMUST00000185213 621 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Trav22-201ENSMUST00000198117 346 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Gm44988-201ENSMUST00000203835 1161 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Gm10610-203ENSMUST00000208877 1206 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 AC164123.1-201ENSMUST00000213385 447 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Pah-204ENSMUST00000219813 789 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Gm7762-201ENSMUST00000220595 604 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 AC153152.2-201ENSMUST00000223165 959 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 CT030254.3-201ENSMUST00000225959 1231 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Vmn1r55-201ENSMUST00000098844 1284 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 AC124426.1-203ENSMUST00000221814 1362 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Gm16294-201ENSMUST00000070382 1459 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Olfr1296-ps1-201ENSMUST00000117697 939 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Gm15166-201ENSMUST00000120790 385 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Gm13776-201ENSMUST00000122236 1261 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Piga-204ENSMUST00000133813 1086 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Fam117bQ3U3E2 Gm21489-201ENSMUST00000189668 818 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms