Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms