Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms