Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccndbp1Q3TVC7 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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