Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Usp39Q3TIX9 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Usp39Q3TIX9 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Usp39Q3TIX9 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Usp39Q3TIX9 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Usp39Q3TIX9 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 505.7 ms