Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp2b3Q0VF55 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp2b3Q0VF55 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms