Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rab42Q0PD08 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms