Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tff1Q08423 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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