Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnn2Q08093 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms