Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Cnn1Q08091 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Cnn1Q08091 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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Cnn1Q08091 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Cnn1Q08091 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Cnn1Q08091 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cnn1Q08091 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cnn1Q08091 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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