Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
MestQ07646 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MestQ07646 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MestQ07646 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MestQ07646 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
MestQ07646 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MestQ07646 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
MestQ07646 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MestQ07646 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
MestQ07646 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MestQ07646 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
MestQ07646 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MestQ07646 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MestQ07646 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MestQ07646 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MestQ07646 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MestQ07646 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MestQ07646 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MestQ07646 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MestQ07646 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MestQ07646 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
MestQ07646 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MestQ07646 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
MestQ07646 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MestQ07646 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MestQ07646 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
MestQ07646 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MestQ07646 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MestQ07646 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MestQ07646 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
MestQ07646 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
MestQ07646 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MestQ07646 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
MestQ07646 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MestQ07646 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MestQ07646 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
MestQ07646 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MestQ07646 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
MestQ07646 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MestQ07646 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MestQ07646 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
MestQ07646 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MestQ07646 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MestQ07646 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MestQ07646 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MestQ07646 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
MestQ07646 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
MestQ07646 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
MestQ07646 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MestQ07646 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
MestQ07646 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
MestQ07646 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
MestQ07646 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
MestQ07646 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
MestQ07646 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
MestQ07646 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MestQ07646 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
MestQ07646 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MestQ07646 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MestQ07646 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MestQ07646 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MestQ07646 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MestQ07646 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MestQ07646 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MestQ07646 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MestQ07646 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MestQ07646 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
MestQ07646 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
MestQ07646 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MestQ07646 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MestQ07646 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MestQ07646 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MestQ07646 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MestQ07646 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
MestQ07646 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
MestQ07646 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MestQ07646 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MestQ07646 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MestQ07646 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MestQ07646 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MestQ07646 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MestQ07646 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms