Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Sh3bp2Q06649 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Sh3bp2Q06649 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Sh3bp2Q06649 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Sh3bp2Q06649 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Sh3bp2Q06649 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Sh3bp2Q06649 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Sh3bp2Q06649 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Sh3bp2Q06649 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Sh3bp2Q06649 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Sh3bp2Q06649 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms