Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Cbll1-205ENSMUST00000188326 1399 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm7609-203ENSMUST00000160058 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm28065-201ENSMUST00000185290 833 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm3942-201ENSMUST00000218495 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 AC163651.2-202ENSMUST00000222628 1192 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm5142-201ENSMUST00000066558 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Prelid2-201ENSMUST00000070949 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Mndal-204ENSMUST00000188804 2026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sox12Q04890 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm25317-201ENSMUST00000116824 129 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm12637-201ENSMUST00000130501 368 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm22698-201ENSMUST00000175375 108 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm20830-202ENSMUST00000190426 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Olfr1483-ps1-201ENSMUST00000208241 334 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm8637-201ENSMUST00000212919 1085 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 1700111E14Rik-201ENSMUST00000031863 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Olfr855-201ENSMUST00000061693 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Klri1-201ENSMUST00000088046 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 5830473C10Rik-202ENSMUST00000200765 1691 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm6806-201ENSMUST00000120092 1006 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 A930041C12Rik-201ENSMUST00000149156 537 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm5538-201ENSMUST00000168156 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm37355-201ENSMUST00000193345 606 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm18150-201ENSMUST00000195341 645 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Sox12Q04890 Gm44422-201ENSMUST00000204142 1025 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms