Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rbp4Q00724 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms