Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Itga4Q00651 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms