Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Atp9bP98195 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Atp9bP98195 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Atp9bP98195 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp9bP98195 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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