Protein–RNA interactions for Protein: P83510

Tnik, Traf2 and NCK-interacting protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnikP83510 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TnikP83510 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TnikP83510 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TnikP83510 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TnikP83510 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TnikP83510 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TnikP83510 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TnikP83510 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TnikP83510 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TnikP83510 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TnikP83510 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TnikP83510 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TnikP83510 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TnikP83510 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TnikP83510 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TnikP83510 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TnikP83510 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TnikP83510 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TnikP83510 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TnikP83510 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TnikP83510 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TnikP83510 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TnikP83510 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TnikP83510 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TnikP83510 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TnikP83510 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TnikP83510 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TnikP83510 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TnikP83510 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TnikP83510 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TnikP83510 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TnikP83510 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TnikP83510 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TnikP83510 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TnikP83510 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TnikP83510 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TnikP83510 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TnikP83510 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TnikP83510 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TnikP83510 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TnikP83510 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TnikP83510 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TnikP83510 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TnikP83510 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TnikP83510 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TnikP83510 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TnikP83510 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TnikP83510 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TnikP83510 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TnikP83510 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TnikP83510 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TnikP83510 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TnikP83510 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TnikP83510 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TnikP83510 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TnikP83510 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TnikP83510 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TnikP83510 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TnikP83510 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TnikP83510 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TnikP83510 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TnikP83510 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TnikP83510 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TnikP83510 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TnikP83510 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TnikP83510 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TnikP83510 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TnikP83510 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TnikP83510 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TnikP83510 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TnikP83510 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TnikP83510 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TnikP83510 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TnikP83510 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TnikP83510 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TnikP83510 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TnikP83510 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TnikP83510 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TnikP83510 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TnikP83510 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TnikP83510 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TnikP83510 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TnikP83510 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TnikP83510 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TnikP83510 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TnikP83510 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TnikP83510 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TnikP83510 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TnikP83510 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TnikP83510 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TnikP83510 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TnikP83510 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TnikP83510 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TnikP83510 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TnikP83510 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TnikP83510 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TnikP83510 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TnikP83510 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TnikP83510 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TnikP83510 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms