Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx3P81067 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx3P81067 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx3P81067 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx3P81067 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx3P81067 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx3P81067 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx3P81067 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx3P81067 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx3P81067 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx3P81067 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx3P81067 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irx3P81067 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms