Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx2P80206 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx2P80206 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx2P80206 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx2P80206 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx2P80206 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
Otx2P80206 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms