Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rad50P70388 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad50P70388 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rad50P70388 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rad50P70388 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad50P70388 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rad50P70388 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad50P70388 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad50P70388 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad50P70388 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad50P70388 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rad50P70388 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rad50P70388 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rad50P70388 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rad50P70388 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rad50P70388 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad50P70388 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rad50P70388 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad50P70388 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rad50P70388 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rad50P70388 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad50P70388 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad50P70388 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad50P70388 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad50P70388 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad50P70388 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rad50P70388 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad50P70388 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad50P70388 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad50P70388 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad50P70388 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad50P70388 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rad50P70388 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rad50P70388 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rad50P70388 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad50P70388 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rad50P70388 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rad50P70388 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rad50P70388 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rad50P70388 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad50P70388 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rad50P70388 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rad50P70388 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rad50P70388 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad50P70388 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rad50P70388 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad50P70388 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad50P70388 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rad50P70388 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rad50P70388 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rad50P70388 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad50P70388 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rad50P70388 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rad50P70388 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad50P70388 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rad50P70388 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rad50P70388 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rad50P70388 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad50P70388 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad50P70388 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad50P70388 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad50P70388 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rad50P70388 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rad50P70388 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad50P70388 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad50P70388 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad50P70388 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad50P70388 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad50P70388 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad50P70388 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad50P70388 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad50P70388 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad50P70388 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad50P70388 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad50P70388 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad50P70388 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad50P70388 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad50P70388 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad50P70388 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad50P70388 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rad50P70388 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad50P70388 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad50P70388 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad50P70388 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rad50P70388 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rad50P70388 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rad50P70388 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rad50P70388 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rad50P70388 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad50P70388 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad50P70388 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rad50P70388 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad50P70388 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad50P70388 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rad50P70388 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad50P70388 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rad50P70388 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rad50P70388 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rad50P70388 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rad50P70388 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms