Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbdsP70122 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SbdsP70122 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbdsP70122 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbdsP70122 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SbdsP70122 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SbdsP70122 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbdsP70122 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbdsP70122 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbdsP70122 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbdsP70122 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SbdsP70122 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms