Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SnrpfP62307 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SnrpfP62307 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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