Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vbp1P61759 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms