Protein–RNA interactions for Protein: P61079

Ube2d3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d3P61079 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ube2d3P61079 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms