Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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Dpf3P58269 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Dpf3P58269 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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