Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CtnsP57757 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtnsP57757 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtnsP57757 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtnsP57757 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtnsP57757 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtnsP57757 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtnsP57757 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
CtnsP57757 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtnsP57757 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CtnsP57757 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms