Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
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Cldn18P56857 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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