Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp5P56399 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Usp5P56399 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Usp5P56399 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp5P56399 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp5P56399 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Usp5P56399 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Usp5P56399 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Usp5P56399 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp5P56399 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp5P56399 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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