Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Sh3bp1P55194 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Sh3bp1P55194 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Sh3bp1P55194 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Sh3bp1P55194 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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