Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rad23bP54728 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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