Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PctpP53808 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PctpP53808 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PctpP53808 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PctpP53808 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PctpP53808 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PctpP53808 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PctpP53808 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PctpP53808 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PctpP53808 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PctpP53808 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PctpP53808 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PctpP53808 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PctpP53808 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PctpP53808 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PctpP53808 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PctpP53808 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PctpP53808 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PctpP53808 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PctpP53808 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PctpP53808 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PctpP53808 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PctpP53808 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PctpP53808 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PctpP53808 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PctpP53808 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PctpP53808 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PctpP53808 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PctpP53808 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PctpP53808 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PctpP53808 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PctpP53808 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PctpP53808 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PctpP53808 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PctpP53808 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PctpP53808 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PctpP53808 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PctpP53808 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PctpP53808 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PctpP53808 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PctpP53808 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PctpP53808 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PctpP53808 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PctpP53808 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PctpP53808 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PctpP53808 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PctpP53808 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PctpP53808 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PctpP53808 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PctpP53808 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PctpP53808 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PctpP53808 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PctpP53808 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PctpP53808 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PctpP53808 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PctpP53808 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PctpP53808 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PctpP53808 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PctpP53808 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PctpP53808 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PctpP53808 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PctpP53808 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PctpP53808 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PctpP53808 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PctpP53808 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PctpP53808 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PctpP53808 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PctpP53808 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PctpP53808 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PctpP53808 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PctpP53808 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PctpP53808 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PctpP53808 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PctpP53808 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PctpP53808 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PctpP53808 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PctpP53808 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PctpP53808 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PctpP53808 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PctpP53808 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PctpP53808 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PctpP53808 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PctpP53808 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PctpP53808 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PctpP53808 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PctpP53808 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PctpP53808 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PctpP53808 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PctpP53808 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PctpP53808 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PctpP53808 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PctpP53808 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PctpP53808 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PctpP53808 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PctpP53808 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PctpP53808 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PctpP53808 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PctpP53808 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PctpP53808 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PctpP53808 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms