Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FmodP50608 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FmodP50608 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FmodP50608 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FmodP50608 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FmodP50608 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FmodP50608 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
FmodP50608 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
FmodP50608 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FmodP50608 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
FmodP50608 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
FmodP50608 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
FmodP50608 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
FmodP50608 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
FmodP50608 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
FmodP50608 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FmodP50608 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FmodP50608 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FmodP50608 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
FmodP50608 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FmodP50608 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FmodP50608 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FmodP50608 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FmodP50608 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
FmodP50608 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
FmodP50608 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
FmodP50608 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FmodP50608 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FmodP50608 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FmodP50608 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FmodP50608 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
FmodP50608 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
FmodP50608 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
FmodP50608 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
FmodP50608 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
FmodP50608 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
FmodP50608 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
FmodP50608 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
FmodP50608 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
FmodP50608 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
FmodP50608 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
FmodP50608 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
FmodP50608 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
FmodP50608 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
FmodP50608 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
FmodP50608 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
FmodP50608 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
FmodP50608 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
FmodP50608 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
FmodP50608 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
FmodP50608 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
FmodP50608 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
FmodP50608 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
FmodP50608 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
FmodP50608 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
FmodP50608 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
FmodP50608 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
FmodP50608 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
FmodP50608 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
FmodP50608 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
FmodP50608 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
FmodP50608 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
FmodP50608 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
FmodP50608 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
FmodP50608 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
FmodP50608 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
FmodP50608 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
FmodP50608 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
FmodP50608 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
FmodP50608 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
FmodP50608 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
FmodP50608 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
FmodP50608 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
FmodP50608 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
FmodP50608 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
FmodP50608 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
FmodP50608 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
FmodP50608 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
FmodP50608 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
FmodP50608 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
FmodP50608 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FmodP50608 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FmodP50608 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FmodP50608 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
FmodP50608 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
FmodP50608 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FmodP50608 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
FmodP50608 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FmodP50608 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FmodP50608 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FmodP50608 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FmodP50608 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FmodP50608 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FmodP50608 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
FmodP50608 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
FmodP50608 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
FmodP50608 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
FmodP50608 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
FmodP50608 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
FmodP50608 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms