Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LtbrP50284 5930422O12Rik-201ENSMUST00000059351 840 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbrP50284 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbrP50284 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbrP50284 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbrP50284 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbrP50284 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbrP50284 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbrP50284 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbrP50284 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbrP50284 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbrP50284 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbrP50284 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LtbrP50284 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LtbrP50284 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms